در یکی دو سال اخیر انتقادات زیادی از نحوه دریافت وجه و ثبت نام در دوره‌های فدراسیون بدنسازی مطرح می‌شود، ولی مشخص نیست چرا بر این موضوع نظارت جدی وجود ندارد؟

حضور یک فرد دوتابعیتی در فدراسیون بدنسازی که گذشته قابل انتقادی نیز دارد، شائبه هایی را به وجود آورده است.

فدراسیون بدنسازی و پرورش اندام در حالی مدعی مشارکت در ساخت یک برنامه تلویزیونی شده است که تهیه کننده این برنامه ادعای این فدراسیون را تکذیب کرده است.