در سال‌های اخیر، برخی چالش‌ها به فهرست ابر چالش‌ها و مسائل حل نشده آموزش عالی اضافه شده‌اند. از کاهش رتبه علمی تا بلاتکلیفی مدیریتی مسائلی هستند که در سال ۱۴۰۴ نیازمند پیگیری جدی هستند.