تغییرات اخیر در ساختار فرماندهی نیروهای مسلح و ادغام ستادکل نیروهای مسلح و قرارگاه مرکزی خاتمالانبیاء(ص)، صرفاً یک جابهجایی سازمانی نیست؛ بلکه بخشی از روند تطبیق ساختار فرماندهی با تغییرات دکترین دفاعی جمهوری اسلامی ایران و الزامات ناشی از تحول ماهیت جنگ و تهدیدها به شمار میرود؛ روندی که پس از جنگ ۱۲ روزه آغاز شد.